겟타로보원작의 스토리 마지막 부분에서 무사시는 겟타를 타고 공룡제국에 맞서 싸우고 하야토와 사오토메 박사는 진겟타를 가동하려하지만 실패하게 된다. 그 순간 무사시는 겟타선을 발동시키게 되고 거기에 맞추어 진겟타 역시 겟타선을 방출함으로써 공룡제국을 쓰러뜨리게 되지만 무사시는 전사하게된다. 시간이 흐르고 하야토는 공룡제국의 재침입을 예상하고 시키시마 박사가 만든 플라즈마 에너지로 구동하는 네오겟타의 파일럿을 모으게 되고 쇼, 가이에 이은 이치모지 고를 영입하게 된다. 네오겟타로 적들을 물리치지만 공룡제국이 탈취한 프로토겟타들과 메카자우르스에게 네오겟타는 엉망이 되게 되고 이치몬지는 진겟타를 발동시켜서 적을 물리친다. 남극의 지하에서 미지의 UFO를 얻어 거대한 힘을 얻은 공룡제국의 고르제왕에 맞서 진겟타가 싸우지만 역부족, 위기에 처하자 진겟타는 파일럿들의 의지에 의해 새로운 형태로 변하여 고르를 물리치게 되는데....